Die Systemwiederherstellung von Windows rettet keine Daten, dazu bräuchte es eine Datensicherung... Gelöscht wurden sie wohl auch kaum, da müssten sie entweder im Papierkorb sein oder es müsste eine Meldung erscheinen, dass es zu viele Daten sind, um in den Papierkorb zu verschieben und ob man sie wirklich löschen will.
Das wahrscheinlichste ist schon, dass die Daten aus versehen in einen anderen Ordner verschoben wurden. Wobei man sie ja dann mit einer Suche wieder finden müsste...
Recovery Tools findest du beim Hersteller der Harddisk. Ich würde nur Tools vom Hersteller verwenden und keine Freeware oder ähnliches, welches die HD unter umständen noch mehr beschädigt.